Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4008254	4008369	116	102 [0]	[0] 88	yhiJ	hypothetical protein

AGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGA  >  W3110S.gb/4008370‑4008434 |                                                                 aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:331628/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:575854/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:51464/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:476941/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:473327/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:431902/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:414189/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:406986/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:393705/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:369189/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:364150/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:583919/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:314543/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:30032/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:267647/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:260875/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:251627/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:246035/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:245967/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:2362/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:227490/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:223538/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:7767/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:992339/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:990132/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:950598/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:939056/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:916255/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:905563/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:839740/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:828431/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:813299/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:800220/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:205859/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:770701/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:769259/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:753149/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:71490/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:705106/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:683212/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:673557/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:664471/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:620041/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:594941/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1246413/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:100913/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:139531/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1350536/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1350263/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1348237/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1280987/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1266422/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1261993/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:125473/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:124841/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1453661/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1200605/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1187502/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1161052/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1137282/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1125943/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:110140/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1091973/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1047170/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1022685/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1010143/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1721481/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:202147/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:196479/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1884504/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1879046/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1835842/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1826999/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1804467/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1786215/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1761551/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1715725/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1675596/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1654358/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1652637/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1641554/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1592907/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1543808/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:152975/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1503859/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1496453/65‑1 (MQ=255) aGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCA‑AAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1159900/64‑1 (MQ=255) aGAAGCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGa  <  1:1494854/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGAATCTATTTCTCCAATTGTTTACCCGTTGATCCCACAAGTACCAGACCAACCTATTTTGGTGA  >  W3110S.gb/4008370‑4008434

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑