Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4008980	4009013	34	37 [0]	[0] 47	yhiJ	hypothetical protein

TGAAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATAAAA  >  W3110S.gb/4009014‑4009066 |                                                     tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGc                   >  1:1477472/1‑36 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:762279/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1006226/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1852105/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:338611/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:383672/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:427715/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:499207/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:506109/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:534435/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:636415/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:671043/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1851289/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:765508/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:784246/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:814253/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:831287/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:883297/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:889891/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:912180/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:93013/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:938354/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:9959/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1743132/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:103689/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1041039/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1050293/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1140048/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1145278/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1188262/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1210755/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:124168/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1261375/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1267813/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1293437/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1322931/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1323519/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1458787/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1528829/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1575396/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1582026/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1652393/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1660569/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaaa  >  1:1777436/1‑53 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaa   >  1:674715/1‑52 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATaaa   >  1:1868907/1‑52 (MQ=255) tgaAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATAATCAATaaaa  >  1:737571/1‑53 (MQ=255) |                                                     TGAAATGACCAATGCTCTCGATCCGGTCGAATTAGCGGCAATTATCAATAAAA  >  W3110S.gb/4009014‑4009066

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑