Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4009155	4009177	23	19 [0]	[0] 35	yhiJ	hypothetical protein

CACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGA  >  W3110S.gb/4009178‑4009242 |                                                                 cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:718925/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:438283/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:469228/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:503223/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:530863/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:575990/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:616752/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:629878/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:672104/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:40208/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:722208/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:730482/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:765949/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:82856/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:837164/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:86600/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:910389/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:946578/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:152741/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1076467/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1121492/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1127137/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1127139/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1318146/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1428229/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1458012/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1479743/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1064555/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1797344/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1843093/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:1882827/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:232017/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:27406/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:292275/65‑1 (MQ=255) cACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGa  <  1:350023/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACTATTAGCATGTTCACAAATGTTAGGTATAAATCAAGTTGTTGCACATAACGGAAATGGTGGA  >  W3110S.gb/4009178‑4009242

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑