Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4017614–4017654	4021187	3534–3574	50 [0]	[0] 93	rhsB	rhsB element core protein RshB

GTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAT  >  W3110S.gb/4021188‑4021252 |                                                                 gTCATGTCACCCTGCCGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1788119/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTc                               >  1:6819/1‑36 (MQ=40) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTaa                        >  1:1762897/1‑43 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAAt                     >  1:247449/1‑46 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATc                    >  1:1103420/1‑47 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCtt                 >  1:692077/1‑50 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTaa   >  1:60124/1‑64 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:423928/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:53266/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:527747/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:525750/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:502712/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:478185/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:473440/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:46413/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:57208/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:408900/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:408452/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:387341/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:383404/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:379554/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:37496/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:3634/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:337004/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:331044/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:327132/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:773226/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:993668/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:953789/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:93898/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:900169/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:891695/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:850818/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:82947/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:820774/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:806867/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:791852/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:552678/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:726526/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:693384/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:618892/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:61884/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:618425/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:609341/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:595373/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:58059/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:301210/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:564808/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1171681/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1484371/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1477736/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1467818/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1442586/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1405827/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1353201/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1278087/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1262596/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1202786/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:120228/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1548676/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1158375/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1152129/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1106491/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1084380/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1081024/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1073185/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1069845/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1059872/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1045655/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1045339/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1859880/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:322772/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1020923/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:289842/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:282558/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:282446/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:254045/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:210748/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:210503/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1862304/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:32335/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1855358/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:185110/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1824299/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1808385/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1802906/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1738395/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:170767/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1646988/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1586842/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:1576837/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTATAAt  >  1:877670/1‑65 (MQ=255) gTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTCCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAt  >  1:199417/1‑65 (MQ=255) |                                                                 GTCATGTCACCCTGACGCGCCGCCGGTTTTCCGCTCATCGTAAAATCCTTTTCTATTATTTTAAT  >  W3110S.gb/4021188‑4021252

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑