Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4042761	4042827	67	2 [0]	[0] 84	yhhK/livK	conserved hypothetical protein/leucine transporter subunit

CACAACATCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGGATG  >  W3110S.gb/4042828‑4042892 |                                                                 cacaaccTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:144095/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:52454/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:673816/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:653229/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:650372/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:649545/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:60159/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:595066/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:591134/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:560609/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:558160/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:704935/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:472223/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:433623/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:428196/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:428012/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:42324/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:417237/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:339965/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:329258/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:325880/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:302680/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:805341/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:949579/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:921944/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:919008/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:91684/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:892758/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:862306/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:842364/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:837110/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:831620/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:827581/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:703593/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:802672/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:787704/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:782306/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:76899/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:768951/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:763750/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:727614/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:713111/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:251652/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1198264/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1542084/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1466009/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1442159/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1437707/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1388031/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1376664/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1341440/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:133751/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1309503/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1263597/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1585986/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1175998/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:116600/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1159107/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1140068/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1127086/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:111579/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:106513/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1035879/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1023349/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1761140/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:251262/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1996/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1886510/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1859117/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1853920/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:184482/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1842005/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1818516/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1761654/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1002327/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1758502/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1748102/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1730418/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1728677/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1720605/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1664476/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1659511/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1629807/65‑1 (MQ=255) cacaacaTCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGgatg  <  1:1606687/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACAACATCACGAATGGGGATTTTTGACTATGAAACGGAATGCGAAAACTATCATCGCAGGGATG  >  W3110S.gb/4042828‑4042892

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑