Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4073542	4073556	15	131 [0]	[0] 39	glgA	glycogen synthase

CTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCT  >  W3110S.gb/4073557‑4073621 |                                                                 cTGCCTTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:250726/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:381911/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1834547/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1863122/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:189096/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:213608/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:255218/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:296274/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:323161/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:362572/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1791709/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:446872/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:593970/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:602088/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:918403/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:926252/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:934416/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:9480/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:981412/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:985626/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:157493/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1188660/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1234389/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1313621/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1422579/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1426749/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1430185/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1442292/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:14736/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1508746/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1186466/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1583422/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1592276/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1626923/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:163682/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:173337/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1757106/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:178609/65‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCt  <  1:1789706/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGCCGTTAGTGCGGCGCACCGGTGGGCTTGCTGATACGGTTTCTGACTGTTCTCTTGAGAACCT  >  W3110S.gb/4073557‑4073621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑