Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4081559 4081756 198 143 [0] [0] 121 rtcR sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

GGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGA  >  W3110S.gb/4081757‑4081821
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GGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGA  >  W3110S.gb/4081757‑4081821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑