Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4118053	4118358	306	102 [0]	[0] 68	yrfD	predicted pilus assembly protein

GGCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGC  >  W3110S.gb/4118359‑4118423 |                                                                 ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCgcgc        >  1:1601891/1‑59 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCta      >  1:1525236/1‑60 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTgggg   >  1:600223/1‑64 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTgggg   >  1:1338236/1‑64 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTgggg   >  1:1298353/1‑64 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTgggg   >  1:364244/1‑64 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTg      >  1:37441/1‑61 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:547864/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:202988/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:546410/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:506593/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:426728/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:304086/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:266925/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:258285/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:257498/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:253680/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:22286/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:222678/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1754498/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:559852/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:60836/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:639328/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:645281/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:693014/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:749085/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:886453/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:901145/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:922524/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:92280/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:935212/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:95061/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:964737/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:967027/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:97496/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:999725/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1387877/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1065509/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1099308/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1133642/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1150560/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1164439/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1185636/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1188463/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1191230/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:119313/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1193460/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1217394/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1237160/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1244090/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1279749/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1317061/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1875873/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1424185/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1429773/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1452373/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1511374/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1548977/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1562762/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1585484/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1617539/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1620309/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1623377/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1638804/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1747485/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:102865/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGc  >  1:1789849/1‑65 (MQ=255) ggCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCAATCGctct       >  1:1630246/1‑60 (MQ=255) |                                                                 GGCCGTTTCTGTTCGTCAGCCGCCGCTACCGCCGCCAGGTGGAGACTTTGCCATCGCGCTGGGGC  >  W3110S.gb/4118359‑4118423

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑