Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4125923	4126217	295	100 [0]	[0] 56	[rpe]–[gph]	[rpe],[gph]

TGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAT  >  W3110S.gb/4126218‑4126282 |                                                                 tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAAt                             >  1:538044/1‑38 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAATCCGCCCGTTGATGCCGACAt  >  1:502631/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGc                  >  1:679473/1‑49 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGCCAt  >  1:1449813/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACa   >  1:617726/1‑64 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACa   >  1:1179004/1‑64 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACa   >  1:1379417/1‑64 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:554691/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:663663/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:539051/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:485884/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:477810/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:463126/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:434165/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:43205/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1867656/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1847713/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1824896/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:600426/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:176594/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:688732/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:699526/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:772140/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:774343/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:80641/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:861770/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:913397/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:942059/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:977140/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:991310/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1474978/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1079452/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1081237/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1207433/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1344672/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1347802/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1362384/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:13773/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1424876/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1436646/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1438238/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1440215/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1462232/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:17965/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1495195/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1502130/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:150961/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1576504/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1628900/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1635769/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1650830/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:17125/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1714202/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1722125/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAt  >  1:1005328/1‑65 (MQ=255) tGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTAAGCGTAAAACa                               >  1:1719540/1‑36 (MQ=255) |                                                                 TGGGCGCGTCAGGAACGTGCGACTCAGCGTAAAACAATGGGTAAACCGCCCGTTGATGACGACAT  >  W3110S.gb/4126218‑4126282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑