Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4169011	4169012	2	3 [0]	[0] 70	fusA	protein chain elongation factor EF‑G

AAATAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTAA  >  W3110S.gb/4169013‑4169077 |                                                                 aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCTCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:273221/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGtga  <  1:1610735/65‑3 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:337873/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:473385/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:456778/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:444790/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:434528/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:431323/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:382/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:348281/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:496764/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:337261/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:326952/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:26186/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:261821/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:256786/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:238449/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:236879/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:726363/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:970743/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:945587/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:94501/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:890435/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:881467/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:852397/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:800118/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:785855/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:224046/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:693255/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:651489/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:645144/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:643037/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:593933/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:579136/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:578303/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:525260/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1243294/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1007964/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1523895/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1408618/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1387879/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1374474/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1369970/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1333347/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1316867/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1545753/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1226183/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1131508/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1111717/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1105046/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:109072/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1060752/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1022886/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1712167/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:216723/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:212373/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1858502/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1813129/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1790864/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1781055/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1716277/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1562400/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1697799/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1683469/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1651641/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1650726/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1644721/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:161625/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:160894/65‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGGCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTaa  <  1:1186462/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AAATAAGCCTAAGGGTTAATACCAAAGTCCCGTGCTCTCTCCTGAAGGGGAGAGCACTATAGTAA  >  W3110S.gb/4169013‑4169077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑