Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4171885	4171990	106	15 [0]	[0] 58	chiA	periplasmic endochitinase

TTGATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGAA  >  W3110S.gb/4171991‑4172054 |                                                                ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGa                       >  1:342931/1‑43 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTg               >  1:233856/1‑51 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:736941/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:225198/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1014830/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:231423/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:275820/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:304737/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:369869/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:509599/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:546349/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:599228/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:614543/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:727655/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:228008/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:738854/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:786691/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:789379/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:794402/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:846226/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:849497/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:857343/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:860927/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:86131/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:881748/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:893412/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:949759/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:991596/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1603619/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1048337/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1055338/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1118039/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1260831/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1272774/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1333408/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1344873/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1374311/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1398553/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1447989/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1507449/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1516221/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:154790/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:204790/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1623776/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1640024/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1647862/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1706317/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:172113/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1725697/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1788975/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1807196/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1817844/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1878018/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:199122/1‑64 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGa   >  1:459434/1‑63 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGa   >  1:39766/1‑63 (MQ=255) ttgATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAAACCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:698550/1‑64 (MQ=255) ttgATGCGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGaa  >  1:1503412/1‑64 (MQ=255) |                                                                TTGATGGGCAGGCTTATGAAGCGCTGTTCTGGACGCAAAGTGACAACCCTGCTCTGGTGGCGAA  >  W3110S.gb/4171991‑4172054

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑