Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4175262	4175364	103	28 [0]	[0] 52	[gspM]–[gspL]	[gspM],[gspL]

CACTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAACGA  >  W3110S.gb/4175365‑4175429 |                                                                 cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCATGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1410247/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:676130/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:291387/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:291566/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:30936/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:331459/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:337097/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:361664/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:366304/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:414557/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:440044/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:523823/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:588969/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:629019/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:658836/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:241350/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:682922/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:682978/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:690600/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:722310/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:800433/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:802048/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:858822/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:908345/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:93361/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:955624/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:974146/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1532162/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1066832/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1154004/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1200226/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1226098/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1234032/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1256375/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1272722/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1346911/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1459333/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1481706/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1487670/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1503253/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1015665/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1568469/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1692588/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1704959/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1736016/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1743795/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1795897/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1798578/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1805990/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1837530/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:1849161/65‑1 (MQ=255) cacTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAAcga  <  1:2303/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACTGACCGGATCTTTTTCTGTTTTTTCCATCGGAAGCCAGGACTGTGTTAACTCACAGAAACGA  >  W3110S.gb/4175365‑4175429

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑