Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4185474	4185821	348	33 [0]	[0] 35	gspA	general secretory pathway component, cryptic

CGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATGTGGTG  >  W3110S.gb/4185822‑4185886 |                                                                 cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGat                 >  1:1082970/1‑50 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:217735/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:910111/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:372403/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:385776/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:387780/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:401268/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:470193/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:477292/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:540799/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:620559/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:631855/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:642684/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:687420/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:815455/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:86159/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:10219/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:138862/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:112272/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1133033/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1133252/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1193242/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1249725/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1288185/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1303368/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:217009/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1399755/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1491370/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1539246/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:163241/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1682143/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:1702551/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:19057/1‑65 (MQ=255) cGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTAATgtggtg  >  1:297709/1‑65 (MQ=255) cGTGGCCGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATgtggtg  >  1:819336/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGTGGCTGATACCCGTAACGCCAGTAGTTAAACAAGATATGACTAAGGATATTGCTCATGTGGTG  >  W3110S.gb/4185822‑4185886

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑