Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4186707	4186713	7	7 [0]	[0] 49	pioO	part of gsp divergon involved in type II protein secretion

AATCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCGAGGA  >  W3110S.gb/4186714‑4186774 |                                                             aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCcgtc                   >  1:478557/1‑44 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgatga  >  1:1415047/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:653809/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:318532/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:361897/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:452175/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:454339/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:482834/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:543467/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:561736/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:570234/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:581707/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:594745/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:282734/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:673908/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:678086/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:747968/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:815245/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:845942/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:893172/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:908315/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:952722/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:95351/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:968202/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:281442/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1104528/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1107915/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1170949/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1218656/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1230353/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1398246/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1499093/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1533111/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1543966/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1548261/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1574237/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:169905/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1732492/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1792559/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:179338/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1843986/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1849879/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:211846/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:212666/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:241078/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:251532/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagga  >  1:1095479/1‑61 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCgagg   >  1:804905/1‑60 (MQ=255) aaTCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCAGTCgagga  >  1:603584/1‑61 (MQ=255) |                                                             AATCAACACAACACTATTTCTTCAAAAAACAGCCACTCCCCGTCGTCGAATCCGTCGAGGA  >  W3110S.gb/4186714‑4186774

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑