Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4254179	4254240	62	5 [0]	[0] 91	malM/yjbI	maltose regulon periplasmic protein/conserved hypothetical protein

TGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCA  >  W3110S.gb/4254241‑4254305 |                                                                 tGGACTTTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1761953/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:280681/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:449664/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:432734/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:427409/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:413925/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:3877/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:325317/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:309524/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:304480/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:301614/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:294204/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:293835/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:453252/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:219349/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:207126/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1885173/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1868283/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1845782/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1838026/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1826648/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:18161/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:181324/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:64214/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:987363/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:943920/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:884307/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:884164/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:850349/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:812330/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:763022/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:720243/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:71111/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:666460/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:661957/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1763863/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:640362/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:614844/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:559281/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:53296/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:525718/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:525441/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:496867/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:48809/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:477186/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:472209/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1181576/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1292303/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1290523/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:127922/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1277015/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1268849/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1216059/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1214608/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1210246/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1210090/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1184614/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1184275/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:130682/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1175519/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1138077/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:113403/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:111742/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1096760/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1079556/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1077991/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1056311/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1049570/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1035792/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1545736/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1029140/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1749610/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:162427/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1619778/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1609042/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1597833/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1590976/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1580898/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:158073/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1808536/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1524049/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1514908/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1508411/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1505535/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1459031/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1406340/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1387827/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1357784/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1348368/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1322736/65‑1 (MQ=255) tGGACATTCAGGCTACTTTTACAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCa  <  1:1684811/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TGGACATTCAGGCTACTTTTCCAGGTTATTTTATTTCTGTTATGCAGAGGTTTTATGATAAGTCA  >  W3110S.gb/4254241‑4254305

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑