Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4316606	4316800	195	191 [0]	[0] 56	[alsB]–[rpiR]	[alsB],[rpiR]

AGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGG  >  W3110S.gb/4316801‑4316865 |                                                                 agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATTTTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:452734/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAGTGTTGAGCTgg  <  1:488200/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:675294/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:390727/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:417760/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:486796/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:565801/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:593573/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:611189/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:62085/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:625534/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:626749/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:645458/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:648082/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:370269/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:706780/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:749570/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:795797/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:811344/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:814526/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:829888/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:834330/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:862247/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:870511/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:913226/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:928475/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:9448/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:998592/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1711742/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1077529/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1103454/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1141084/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1180326/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1228957/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1424000/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1445499/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:144926/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1471548/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1568100/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1584880/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:167246/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1069863/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1726412/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1741244/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1772181/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:177773/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1779339/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1809035/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1818081/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1820002/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1851688/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:197603/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:201665/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:209397/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:25999/65‑1 (MQ=255) agaagaAATCAACAATTGCGCAGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTgg  <  1:1326258/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGG  >  W3110S.gb/4316801‑4316865

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑