Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4329043	4329272	230	185 [0]	[0] 32	[phnC]	[phnC]

CACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCT  >  W3110S.gb/4329273‑4329337 |                                                                 cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1685501/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:914746/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:88212/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:738718/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:673330/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:648574/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:604367/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:573965/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:46052/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:416232/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:378007/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:355984/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:33841/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:28067/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:186489/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1704209/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1150250/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1614821/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1588504/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1577646/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1531070/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1512850/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1502886/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1498257/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1435077/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1432734/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1432571/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1338294/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1298942/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:127406/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:1213343/65‑1 (MQ=255) cACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCct  <  1:115178/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCT  >  W3110S.gb/4329273‑4329337

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑