Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4342443	4342713	271	34 [0]	[0] 64	[adiY]	[adiY]

AACGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGAT  >  W3110S.gb/4342714‑4342778 |                                                                 aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:657980/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1881358/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:262943/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:274746/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:276989/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:322574/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:332535/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:415946/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:453503/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:461108/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:542505/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:583724/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:584640/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:613046/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:623424/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:623946/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1858808/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:658699/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:660235/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:696983/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:70229/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:70751/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:730543/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:73854/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:740585/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:756087/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:870175/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:878907/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:889856/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:903087/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:936088/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:938287/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:143517/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:103170/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1060902/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1094013/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1105266/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1170286/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1172408/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1180108/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:11945/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1200465/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1265793/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1292345/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1309480/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1329349/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1333291/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1399089/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1022726/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1443135/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1492084/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1514874/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1518878/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1587166/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1618653/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1621361/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1662469/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1686421/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1693863/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1737402/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:179497/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1815981/65‑1 (MQ=255) aaCGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1833804/65‑1 (MQ=255) aaCGAGCTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGat  <  1:1808038/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AACGAGTTTTACTAATAGTACAAATTTTTATAGTAATTTCTCATGTACATATTTTTTTACAGGAT  >  W3110S.gb/4342714‑4342778

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑