Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4379085	4379091	7	40 [0]	[0] 47	yjeJ/yjeK	hypothetical protein/predicted lysine aminomutase

GCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTT  >  W3110S.gb/4379092‑4379143 |                                                    gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAGGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:694698/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:520185/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1826807/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:190467/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:21335/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:219454/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:336311/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:379152/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:396611/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:444157/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:454638/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:487259/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:500891/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1810066/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:612386/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:701736/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:727713/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:730590/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:770986/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:812799/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:919365/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:934930/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:947408/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:979974/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1422379/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1056587/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1087337/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1103338/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1143668/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1172/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1196838/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1246544/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:125459/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1318031/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:137808/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1403622/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1023800/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1479904/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1492750/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1548392/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1584841/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1605398/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1669746/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1723854/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1770402/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1772232/52‑1 (MQ=255) gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGtt  <  1:1775637/52‑1 (MQ=255) |                                                    GCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTT  >  W3110S.gb/4379092‑4379143

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑