Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	416271	416450	180	41 [0]	[0] 100	[phoB]	[phoB]

CGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAATT  >  W3110S.gb/416451‑416515 |                                                                 cGGTCGACGCGGATGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:355594/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACTGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:984044/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCACCtga                         >  1:121339/1‑42 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACtgaa                        >  1:1308757/1‑43 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACtg                          >  1:137695/1‑41 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTTAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1673342/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGCACCCTGGCCGGa         >  1:912861/1‑58 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAAc                   >  1:1646772/1‑48 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAAc                   >  1:1376550/1‑48 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAAc                   >  1:1320335/1‑48 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGAt        >  1:1027786/1‑59 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:385903/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:630128/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:576535/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:567409/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:539632/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:487633/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:46899/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:455808/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:434147/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:430339/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:419375/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:632050/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:361682/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1047650/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:278117/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:257148/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:234874/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:220685/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1231182/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:202313/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1886489/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:749466/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1005563/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:966404/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:950620/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:94968/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:940932/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:935135/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1044532/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:892506/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:785895/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:760213/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:206385/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:733807/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:720865/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:713555/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:711410/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:711272/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:695210/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:691758/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:67743/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:660104/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1333124/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1591078/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1883626/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1582259/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:151932/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1454797/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1453522/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1418940/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1114838/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:115257/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1340641/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:158517/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1325708/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1323571/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1157984/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1208314/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1308183/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1307821/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1272397/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1268535/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1259478/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1239374/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1596602/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1879221/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1805439/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1797245/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1781351/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1769149/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1755847/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1717604/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1703407/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1698202/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1684806/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:168213/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1681498/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:107216/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1668600/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1668490/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:1662454/1‑65 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:740806/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:430323/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:801337/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:533376/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:1577917/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:1073830/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAAt   >  1:600075/1‑64 (MQ=255) cGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTCAATGAACCCTGGCCGGATTTAAtt  >  1:910362/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGGTCGAAGCGGAAGATTATGACAGTGCTGTGAATCAACTGAATGAACCCTGGCCGGATTTAATT  >  W3110S.gb/416451‑416515

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑