Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	417840	417933	94	5 [0]	[0] 100	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

CAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGA  >  W3110S.gb/417934‑417995 |                                                              cAATGATAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCgtt                           >  1:381487/1‑37 (MQ=255) cAATGAAGAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:156775/1‑62 (MQ=255) cAATGAACAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCgttg                          >  1:353546/1‑38 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGTCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1280600/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGTCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1253333/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGTCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1218871/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGcgcg                             >  1:353775/1‑35 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGc             >  1:559738/1‑51 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:467437/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:519135/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:434209/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:370377/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:359254/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:33894/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:314485/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:288577/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:27461/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:25819/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:256643/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:249853/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:227316/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1855851/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:184238/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:178057/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1748477/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1727584/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1697191/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1693642/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:684034/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:998580/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:942870/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:917181/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:907707/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:824738/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:81228/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:807716/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:74172/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:722777/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:71160/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:709655/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:474347/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:670553/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:634581/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:598075/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:596830/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:579009/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:573568/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:54084/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:521348/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1685956/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:489283/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:119320/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1688222/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:132519/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:131864/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1309039/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1292515/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1284002/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:125777/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1254404/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1242377/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1225112/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1205227/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1326352/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1184140/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1183596/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1172998/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:117215/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:117011/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1140886/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1125656/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1112955/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1083526/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1076590/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1066331/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1429097/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1004453/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1677511/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1676433/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:166941/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1633051/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1624575/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1624248/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1534266/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1511354/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1449398/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1443699/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1331789/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1421187/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1414319/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1412152/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:139362/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1388302/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1376223/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1364323/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1347735/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1345074/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:1334206/1‑62 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTAGAGCGCGAGGCt            >  1:564515/1‑52 (MQ=255) cAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGATGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGa  >  1:855491/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAATGAAAAGGTTGATGTGCCGATGATGCTGCGCGTTGTTGAGCGCGAGGCTCAGACTCTGA  >  W3110S.gb/417934‑417995

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑