Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4479314	4479349	36	4 [0]	[0] 40	yjgJ	predicted transcriptional regulator

CAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTGAGG  >  W3110S.gb/4479350‑4479394 |                                             cAACAGCTGCAATGTCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1845507/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGTGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1308216/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgtgg  <  1:846163/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:678670/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1857468/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:196338/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:25395/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:2884/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:350121/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:427353/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:478629/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:671930/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:675785/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:181865/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:685080/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:762157/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:834446/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:869507/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:89348/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:908198/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:938615/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1544412/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1079396/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1089764/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:116392/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1277943/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1287719/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1378799/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1378897/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1402795/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1508813/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1049059/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1546910/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:155510/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1562858/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1591771/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1619475/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:176323/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTgagg  <  1:1799727/45‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATCCTTgagg  <  1:1674200/45‑1 (MQ=255) |                                             CAACAGCTGCAATGGCGGGGGAAGCGATAAAAACTATTCTTGAGG  >  W3110S.gb/4479350‑4479394

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑