Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4536458 4536466 9 2 [0] [1] 179 sgcX/yjhP predicted endoglucanase with Zn‑dependent exopeptidase domain/predicted methyltransferase

Only 100 of 179 total aligned reads displayed.

AATAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAAATAA  >  W3110S.gb/4536466‑4536530
 |                                                               
aaTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1704425/65‑1 (MQ=255)
 aTAAAGGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1237322/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTTGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:144088/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:363655/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:534431/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:493567/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:492271/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:456605/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:437132/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:435103/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:42256/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:418803/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:40552/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:385524/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:562676/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:358714/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:358456/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:347297/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:28533/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:255884/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:255584/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:238589/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:198915/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1856754/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1833352/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1805873/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:706665/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:999071/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:956311/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:938163/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:896363/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:895534/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:870517/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:860024/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:853237/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:818081/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:806148/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:768217/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:747083/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:544712/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:694871/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:694455/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:693451/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:665628/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:655948/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:645426/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:638378/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:637083/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:623523/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:590543/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1767200/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:119347/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1353427/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:135016/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:131490/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1291081/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1286223/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1281439/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1207222/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1204974/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1201211/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1199119/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1197484/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:135873/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1181076/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1153280/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1153269/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1130977/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1119108/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1114333/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1102670/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1089117/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1072550/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1058379/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1036437/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1513785/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:102010/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1746058/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1712928/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1709183/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:164272/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1638515/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1628034/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1586320/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1583024/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1527823/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1525047/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1779895/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1504307/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1500511/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1487829/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:148634/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:145894/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1457999/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:143508/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1419256/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1410340/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1395135/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACCGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:594891/64‑1 (MQ=255)
 aTAAAAGCGCCCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAaataa  <  1:1691908/64‑1 (MQ=255)
 |                                                               
AATAAAAGCGCTCAACGTTTGTGAAAGTTACGGGCTGGAGAGACCAGTGATTATGGTTGAAATAA  >  W3110S.gb/4536466‑4536530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: