Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4539063	4539104	42	77 [0]	[0] 74	yjhX/yjhR	conserved hypothetical protein/predicted frameshift suppressor

AATATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGAA  >  W3110S.gb/4539105‑4539169 |                                                                 aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTTaa  <  1:1460806/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:418126/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:533537/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:514764/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:511139/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:488823/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:466981/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:466684/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:429481/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:427278/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:252021/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:414643/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:411586/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:409705/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:379217/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:376014/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:331667/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:294206/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:288467/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:247505/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:699539/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:987314/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:88843/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:867525/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:788248/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:742175/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:722071/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:715501/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:705189/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:534221/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:680462/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:680044/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:668139/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:651280/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:639073/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:621763/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:609097/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:602350/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1361346/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1015253/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1449718/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1444616/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1427497/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1421370/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1418257/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1372837/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1365329/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1454284/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1272500/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1244053/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1205030/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1144616/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1113808/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1108042/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1078208/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1027745/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1480668/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:226872/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1880343/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1869005/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1736689/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1707831/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1698877/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1690734/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1650727/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1584565/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1578511/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1553128/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1534296/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1525822/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1476876/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGACAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1720791/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGATGATTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1305401/65‑1 (MQ=255) aaTATGCTCACCCATCTTCGACGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGaa  <  1:1812406/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATATGCTCACCCATCTTCGATGCTTGAAAAATTGAAGCCAATCCTGATAAGTAATTTTTTTGAA  >  W3110S.gb/4539105‑4539169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑