Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4546624	4546638	15	3 [0]	[0] 43	fimB/fimE	tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

ATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGT  >  W3110S.gb/4546639‑4546702 |                                                                aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTGCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1842879/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:487885/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1859460/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:281997/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:292300/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:309274/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:309697/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:31092/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:362909/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:385702/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:395860/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:992986/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:557503/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:583557/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:614533/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:624309/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:675577/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:766047/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:820037/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:921121/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:961077/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1023416/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1570429/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1025875/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1040761/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1080680/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1119517/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:119882/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1359321/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1421997/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1434056/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1547786/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1843203/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1574585/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1579028/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1593184/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1604240/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1637535/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1648883/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1683732/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1716990/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1796534/64‑1 (MQ=255) aTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTACTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGt  <  1:1413696/64‑1 (MQ=255) |                                                                ATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGT  >  W3110S.gb/4546639‑4546702

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑