Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4550932	4551164	233	77 [0]	[0] 29	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

ATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGT  >  W3110S.gb/4551165‑4551211 |                                               ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:334158/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:985837/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:958787/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:753203/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:680969/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:652248/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:579058/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:52917/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:516818/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:449432/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:425406/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:424155/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:41210/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:379964/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:37760/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1179497/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:244820/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1743036/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1737404/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1648867/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1541278/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1504154/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1468059/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1434102/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1431656/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1269723/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1248004/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1224652/1‑47 (MQ=255) ataACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGt  >  1:1199702/1‑47 (MQ=255) |                                               ATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGT  >  W3110S.gb/4551165‑4551211

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑