Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4552223	4552340	118	108 [0]	[1] 27	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

CTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCA  >  W3110S.gb/4552335‑4552399       |                                                           cTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1589682/65‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCTATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:56800/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1866464/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:997692/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:900533/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:6975/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:682004/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:666884/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:601846/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:516951/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:474884/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:286787/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:286643/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:240260/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1884372/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1018491/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1616290/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1567165/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1484668/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1458275/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1408818/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1340560/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1338449/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1230157/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1194354/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1094402/59‑1 (MQ=255)       gtgtCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCa  <  1:1045929/59‑1 (MQ=255)       |                                                           CTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCA  >  W3110S.gb/4552335‑4552399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑