Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4578032	4578035	4	24 [0]	[0] 83	yjiT	conserved hypothetical protein

AAGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACA  >  W3110S.gb/4578036‑4578100 |                                                                 aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTctct                     >  1:1543457/1‑46 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTg                    >  1:12874/1‑47 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACCGGCaa    >  1:1492790/1‑63 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACATGCAACa  >  1:1858058/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCaa    >  1:1830390/1‑63 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAAc   >  1:901660/1‑64 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1868227/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:352206/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:333959/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:315372/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:303406/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:240779/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:232133/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:226400/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:204756/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:192708/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:485246/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1843587/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1795350/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1738339/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1722491/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1718000/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1703698/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:718918/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:999178/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:974747/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:967483/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:963142/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:935836/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:916151/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:915687/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:8365/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:802140/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:41675/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:699465/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:685275/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:680077/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:63688/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:621347/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:584405/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:577683/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:52627/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1649707/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1208146/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1356205/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1351305/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1339053/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1314509/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1298906/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:126134/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1260922/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1236444/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1226032/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1362949/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1205660/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1185038/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1161339/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1135749/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1095195/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1089867/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1062771/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1061796/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1057788/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1523744/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1652551/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1022602/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1642249/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1594365/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1578115/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1566655/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1561353/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1556597/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1538766/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1660172/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1517817/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1482957/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1440682/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1436783/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1430545/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1421601/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1419205/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1397940/1‑65 (MQ=255) aaGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACa  >  1:1381068/1‑65 (MQ=255) |                                                                 AAGATGGTGAGGAAGTCTCTGGCCTTGGGCCAGCCTATGCTTCTCTGGAAAACAGACAGGCAACA  >  W3110S.gb/4578036‑4578100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑