Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4616022	4616173	152	24 [0]	[0] 72	[osmY]	[osmY]

CAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAT  >  W3110S.gb/4616174‑4616238 |                                                                 cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:579939/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:691469/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:69055/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:677899/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:666810/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:640768/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:629696/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:595345/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:59406/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:708721/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:55730/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:453343/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:448065/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:406820/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:374810/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:359361/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:350405/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:342108/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:912170/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:974511/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:969718/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:965307/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:964407/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:952141/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:943754/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:940207/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:93353/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:331541/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:873518/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:822894/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:805097/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:776806/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:775758/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:759912/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:729849/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:716329/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1451563/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1003747/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1601555/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1597803/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1595000/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1530024/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1502120/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1481742/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1475845/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1629794/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1390016/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1339859/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1273691/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1173953/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:108101/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1075837/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1040232/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1021920/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:24173/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:325427/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:323901/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:302469/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:273349/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:268499/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:261042/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:259359/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1640713/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:224061/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1881159/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1848406/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1835814/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1757476/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1705921/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1658644/65‑1 (MQ=255) cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1650921/65‑1 (MQ=255) cAGAATACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTATTTTCAt  <  1:1047510/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAT  >  W3110S.gb/4616174‑4616238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑