Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4631080	4631241	162	2 [0]	[0] 94	radA	predicted repair protein

ATGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGA  >  W3110S.gb/4631242‑4631306 |                                                                 aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGa                        >  1:17940/1‑43 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAacac          >  1:842544/1‑57 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACGCTGTATCGa  >  1:1719907/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACAGTGTATCGa  >  1:1171070/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCgc  >  1:1526151/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:345995/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:720967/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:1417456/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:1785018/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:1392463/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCg   >  1:480203/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:373619/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:731113/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:346714/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:689994/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:651730/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:36870/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:633748/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:620366/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:614958/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:430061/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:457333/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:462675/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:593758/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:557037/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:541963/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:49432/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:471536/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:798124/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:971546/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:962274/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:946012/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:912797/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:902220/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:895131/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:890182/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:88696/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:878131/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:811346/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:72609/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:798114/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:797636/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:780440/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:774709/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:749986/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:749765/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:736071/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:733563/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1020581/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1268917/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1492059/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1483785/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1455930/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1440386/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1418573/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1410281/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1400933/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1367273/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1337079/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1279960/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:312916/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1263136/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1253218/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1210610/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1200540/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1151937/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1140698/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1076237/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1066173/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1049657/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1006273/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1547348/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:342737/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:284760/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:28365/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:27178/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:261144/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:188917/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1884566/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1872086/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1836197/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1817960/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1816146/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1816031/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1804939/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1754938/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1745765/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1646549/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1590900/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:1515249/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGCAACACTGt       >  1:1722137/1‑60 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCAGGAACACTGTATCg   >  1:607272/1‑64 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTACGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGa  >  1:982420/1‑65 (MQ=255) aTGGTGGGGCACGTAACAAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCg                         >  1:76674/1‑42 (MQ=255) |                                                                 ATGGTGGGGCACGTAACCAAAGATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGA  >  W3110S.gb/4631242‑4631306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑