Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4641625	4641628	4	11 [0]	[0] 49	creC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon

TGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAG  >  W3110S.gb/4641629‑4641687 |                                                           tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCtat                        >  1:1440895/1‑37 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCaaa   >  1:1018194/1‑58 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCaaa   >  1:742462/1‑58 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:526854/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1847552/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1848511/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1885028/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:266942/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:323290/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:358644/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:373367/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:376285/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:453376/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:479161/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:831400/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:567056/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:928124/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:646958/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:648241/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:658271/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:699943/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:911853/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:752509/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:774179/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:776483/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1456833/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1026119/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1047931/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1048879/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1105024/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1210588/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:12440/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1266602/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1409155/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1416596/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1437830/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1848423/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1498226/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1521528/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1523305/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1576272/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1579282/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1651545/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1751129/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1769129/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1834733/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1842089/1‑59 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGAACGAt               >  1:1867120/1‑46 (MQ=255) tGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATAATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAg  >  1:1053352/1‑59 (MQ=255) |                                                           TGGCATTAACAAAGTGCGCAATGAATATCATGTCTATATGACCGATGCGCAGGGCAAAG  >  W3110S.gb/4641629‑4641687

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑