Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	19272	19302	31	14 [0]	[0] 49	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

CCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGT  >  W3110S.gb/19303‑19367 |                                                                 ccTTGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:337448/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTTACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1372593/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAATGt  <  1:1603194/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:55774/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1868495/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:212560/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:233142/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:252411/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:29300/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:356709/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:376361/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:387374/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:548124/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:550738/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1841327/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:581139/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:618692/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:621898/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:63475/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:648454/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:65723/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:710977/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:845919/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:86807/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:898187/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:995750/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1477597/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:103513/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1123881/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1124234/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1185214/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1213227/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1261240/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1292256/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1296249/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1316052/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1320578/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1397988/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1856928/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1496279/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1500422/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1532968/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1540279/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1627554/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1677664/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1685478/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1834051/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1839500/65‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGt  <  1:1015860/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGT  >  W3110S.gb/19303‑19367

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑