Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	664500	664740	241	65 [0]	[0] 35	[rlpA]	[rlpA]

AAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGT  >  W3110S.gb/664741‑664805 |                                                                 aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:643645/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1079293/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:21028/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:247167/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:248221/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:278149/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:428578/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:576612/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:631021/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1820767/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:651781/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:715338/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:720595/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:763915/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:808373/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:848802/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:97683/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1359548/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1092910/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1118506/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:115338/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1165146/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1168981/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1204384/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1273354/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1327625/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1691098/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:142553/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1454038/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1533062/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1547425/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1552518/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:1629779/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGAGt  <  1:4576/65‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGGCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGt  <  1:467992/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGT  >  W3110S.gb/664741‑664805

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑