Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	43995	44198	204	2 [0]	[0] 31	[fixB]–[fixC]	[fixB],[fixC]

ACGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGT  >  W3110S.gb/44199‑44263 |                                                                 aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCcggttcggtt                             >  1:1106848/1‑38 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCcggttcg                                >  1:1370175/1‑35 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCg                         >  1:393404/1‑42 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGaa     >  1:1611815/1‑62 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:700831/1‑64 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:1498656/1‑64 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:1143673/1‑64 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:1142005/1‑64 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:1062655/1‑64 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAg    >  1:1070751/1‑63 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:865331/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:857311/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:948471/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:50181/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:927962/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:250933/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:238596/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1832099/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1753857/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1600355/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1597403/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1571218/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1427434/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:135837/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1354817/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1323692/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1288917/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1141486/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGt  >  1:1076851/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCACGCCCGCGAAGGt  >  1:224103/1‑65 (MQ=255) aCGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGGTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAgg   >  1:497698/1‑64 (MQ=255) |                                                                 ACGCCATCATCGTCGGTGCAGGGCTTGCCGGTTCGGTTGCCGCACTGGTGCTCGCCCGCGAAGGT  >  W3110S.gb/44199‑44263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑