Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	47595	48146	552	4 [0]	[0] 82	[kefF]–[kefC]	[kefF],[kefC]

ACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGC  >  W3110S.gb/48147‑48211 |                                                                 aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGc                  >  1:1696389/1‑49 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCaa                >  1:857462/1‑51 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCa                 >  1:1053186/1‑50 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:449120/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:594729/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:584078/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:557744/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:542859/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:528310/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:502826/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:495036/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:459798/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:458286/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:646087/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:409267/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:386752/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:333717/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:320625/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:298315/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:204351/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1842714/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1840818/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:823029/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:987711/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:943773/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:94197/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:899198/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:875443/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:857936/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:85568/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:853361/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:853016/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:604490/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:815283/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:810843/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:775097/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:760777/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:744474/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:682565/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:65351/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:647793/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1821694/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1198616/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:134789/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1313422/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1308411/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:129730/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1286635/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1284059/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1262752/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1232806/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1218693/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1360993/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1173733/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1163256/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1147374/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1097375/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1094511/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1080423/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1065584/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1020663/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1015335/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1722632/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1003483/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1821317/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1819352/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1805531/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1778521/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1773897/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1765295/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1761414/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:173667/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1840561/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1651460/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1629981/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:157003/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:153294/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1503831/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1450552/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1421499/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:137481/1‑65 (MQ=255) aCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGc  >  1:1367252/1‑65 (MQ=255) |                                                                 ACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGC  >  W3110S.gb/48147‑48211

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑