Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	939010	939062	53	62 [0]	[0] 66	ycaJ	recombination protein

AATGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGA  >  W3110S.gb/939063‑939127 |                                                                 aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCTGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1779062/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:393119/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:575195/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:537987/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:483993/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:482704/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:456412/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:447206/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:41346/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:412659/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:605707/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:386191/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:377619/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:366614/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:334998/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:333388/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:332509/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:327679/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:684878/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:703273/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:71166/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:761459/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:765646/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:7716/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:786940/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:789169/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:832871/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:874469/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:876715/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:87897/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:938742/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:94162/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:966365/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1513573/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1130953/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1150834/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1154386/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1171901/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1190381/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1209194/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1232682/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1257907/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1299314/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1348712/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1361563/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1418293/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1422420/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1452382/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1485715/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1725711/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:288422/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:247439/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1884661/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1843543/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1827838/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1815434/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1776620/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1728064/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1700499/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:167722/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1631903/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1604473/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1599494/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1534318/65‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGATATGGCCGAAGGCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:1032465/65‑1 (MQ=255) aaTGAGGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGa  <  1:745893/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATGATGGCGGATATGGCCGAAGTCGATGATAGCGGTAAGCGGGTCCTGAAGCCTGAATTACTGA  >  W3110S.gb/939063‑939127

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑