Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	939351	939376	26	146 [0]	[0] 23	ycaJ	recombination protein

TTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTGC  >  W3110S.gb/939377‑939441 |                                                                 ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGcc     >  1:962802/1‑62 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1683845/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:923058/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:921854/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:903139/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:824530/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:711464/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:419265/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:230724/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:17603/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1754213/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:105898/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1617850/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1611281/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1477567/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1453096/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1357223/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1292898/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1246829/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1216160/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTgc  >  1:1135575/1‑65 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTg   >  1:1230483/1‑64 (MQ=255) ttACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTg   >  1:953738/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAACGCGCCATTGCTCAGGCGATTGTTTACCTGGCCTGC  >  W3110S.gb/939377‑939441

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑