Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1020550	1020579	30	52 [0]	[0] 43	ompA/sulA	outer membrane protein A (3a;II*;G;d)/SOS cell division inhibitor

ATCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAG  >  W3110S.gb/1020580‑1020644 |                                                                 atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:521153/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1827353/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1829882/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1886966/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:293147/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:319310/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:319748/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:348741/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:352069/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:389754/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:41416/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1787825/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:623647/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:661307/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:670211/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:782882/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:782993/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:865015/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:894220/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:928367/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:947/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:983287/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1421816/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1076736/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1104955/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1127574/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1129236/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1148641/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1152480/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1222547/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1290101/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1334918/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1397233/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1063579/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:14978/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1502015/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1544019/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:155546/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1602650/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1632644/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1728916/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:174071/65‑1 (MQ=255) atCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAg  <  1:1760086/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATCTTCGGCTTATGCCGAGCACCCCTGGCGATGTAAAGTCTACAACGTAGTTGAAAACTTACAAG  >  W3110S.gb/1020580‑1020644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑