Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1023509	1023621	113	158 [0]	[0] 82	yccS	predicted inner membrane protein

ATCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGT  >  W3110S.gb/1023622‑1023686 |                                                                 aTCGCCACGTAAGTGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:790955/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:426904/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:58465/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:572688/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:559407/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:54349/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:539008/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:523269/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:488725/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:476436/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:464479/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:63157/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:404747/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:392424/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:386984/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:38483/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:368868/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:25298/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:217799/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1862653/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1007428/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:857077/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:99511/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:976066/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:96519/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:958199/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:915247/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:909720/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:905396/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:865116/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:86304/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:624152/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:801395/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:786133/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:782248/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:721029/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:719760/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:699308/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:693802/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:683364/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1837918/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1186695/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1381741/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:136612/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1364197/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1360698/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1318100/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1311150/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1301499/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:127850/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1242669/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1387599/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1181277/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1158083/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1155565/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1150038/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1131468/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1112703/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1110555/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1054455/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1007496/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1615441/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:180348/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1780220/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1746567/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1732753/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1727582/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1713175/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1703973/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1651337/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1644998/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1828017/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1601293/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1592657/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1579583/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1573442/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1525207/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1516232/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1488948/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1413766/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGGCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:945614/65‑1 (MQ=255) aTCGCCACGTAAGCGGGGCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGt  <  1:1443762/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATCGCCACGTAAGCGGGTCAGCAGCGAGAGTTTCGTCTGATTCAATGTCGCCATCAGCAGACCGT  >  W3110S.gb/1023622‑1023686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑