Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1038214	1038334	121	65 [0]	[0] 42	appC	cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

CTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTA  >  W3110S.gb/1038335‑1038399 |                                                                 ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCg                                >  1:990493/1‑35 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGc                              >  1:589073/1‑37 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGCCCATGGAGTTTCAGt           >  1:1265019/1‑56 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCAt                      >  1:906822/1‑45 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTgg       >  1:1537302/1‑60 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTg        >  1:447355/1‑59 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACt   >  1:136296/1‑64 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACt   >  1:1565709/1‑64 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:604432/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:228483/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:260168/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:287142/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:323516/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:543889/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:550210/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1701213/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:760012/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:811606/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:848141/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:935750/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:936687/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:995615/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1060360/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1077055/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:108174/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1264112/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1325804/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1343224/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1373579/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1378650/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:141978/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:142251/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1493833/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1546609/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1552492/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1643903/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1658198/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1749957/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGGTTGGTACTa  >  1:717782/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCAAGGAGTTTCAGTTTGGTa     >  1:932168/1‑62 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTCATGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1654443/1‑65 (MQ=255) ctTCGGTATCAATTTTGCTATTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTa  >  1:1529140/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTA  >  W3110S.gb/1038335‑1038399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑