Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1049682	1049766	85	102 [0]	[0] 77	[ymcC]	[ymcC]

AAAGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCATTTA  >  W3110S.gb/1049767‑1049832 |                                                                  aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCACCCGGGTATCAttt   >  1:438139/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAAcc              >  1:119070/1‑54 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:681314/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:706698/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:584258/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:561392/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:521591/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:490496/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:471302/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:44141/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:43568/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:357263/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:343461/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:283108/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:276517/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:264127/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:262017/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1879983/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1862398/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:850742/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:993442/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:976542/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:968922/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:9567/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:93244/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:893565/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:890041/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:872434/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:191478/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:84592/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:80846/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:7906/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:787915/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:780097/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:727297/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:707967/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1187082/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1451729/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1429041/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1388488/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1367817/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1363596/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:135554/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1327761/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1245560/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1430420/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:118267/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1160167/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1136300/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:107862/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1074041/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1042169/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1016179/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1687468/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1799730/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1758780/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1744267/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1736180/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1734479/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1706100/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1692023/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1468534/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1628643/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1557173/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1469212/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:1383371/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:386745/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:120002/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:6951/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:1000046/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCAtt    >  1:578627/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATAAt     >  1:915109/1‑63 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTACCAtt    >  1:1491341/1‑64 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGAATCAttt   >  1:445015/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGAACGAATATCGCAACCGGGTATCAttt   >  1:1841187/1‑65 (MQ=255) aaaGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAG‑CCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCATTTa  >  1:1533975/1‑65 (MQ=255) aaaGGTAAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGc                  >  1:705960/1‑50 (MQ=255) |                                                                  AAAGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCATTTA  >  W3110S.gb/1049767‑1049832

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑