Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1051484	1051678	195	166 [0]	[0] 68	[cspH]	[cspH]

GCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAG  >  W3110S.gb/1051679‑1051743 |                                                                 gCTAAAATGAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:144601/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:299662/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:428194/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:421977/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:401202/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:381785/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:351132/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:312943/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:308814/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:48175/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:283348/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:281928/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:210254/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:206685/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1882941/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1881259/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1875932/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1873885/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:606058/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:882325/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:852642/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:75234/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:750021/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:701802/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:69874/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:669562/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:613816/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:45865/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:601808/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:591405/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:578183/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:576868/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:521745/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:504005/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1870155/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:120639/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1498439/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1480697/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1465716/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1465235/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1463357/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1438046/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1333152/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1286393/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1525231/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1202751/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1146311/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:110748/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1101979/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1049029/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1016058/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:100871/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1001381/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1563702/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1581569/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:158277/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1587130/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1587536/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1588938/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1635907/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1657172/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1709850/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1728984/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:175385/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1754347/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1764265/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1784163/65‑1 (MQ=255) gCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAagacag  <  1:1793737/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAG  >  W3110S.gb/1051679‑1051743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑