Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1059181	1059190	10	4 [0]	[0] 57	torC	trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c‑type subunit

CTGCTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTGG  >  W3110S.gb/1059191‑1059255 |                                                                 ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCt    >  1:789903/1‑63 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:608656/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1781767/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:181145/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1842037/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:198131/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:299333/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:310244/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:335571/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:345246/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:367591/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:405981/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:449843/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:460104/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:478919/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:177618/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:637875/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:648548/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:767758/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:803742/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:804531/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:808819/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:839586/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:842643/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:938214/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:958693/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:972414/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:984742/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1490420/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:110119/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1104668/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1136635/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1153753/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1178729/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1191609/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1194661/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1199857/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1247543/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1270509/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1318501/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1379690/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:138144/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1443127/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1058479/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1515884/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1527524/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1598683/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1612659/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1659634/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1674098/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1689238/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1694599/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1767620/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1767749/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTgg  >  1:1772187/1‑65 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTg   >  1:1652338/1‑64 (MQ=255) ctgcTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTg   >  1:1867078/1‑64 (MQ=255) |                                                                 CTGCTTCGGAAGTGAAAGTCCTTAAACGTGACGGCGACTGGCTGCAAATTGAAATTACCGGCTGG  >  W3110S.gb/1059191‑1059255

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑