Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1064232	1064388	157	89 [0]	[0] 44	cbpA/yccE	curved DNA‑binding protein, DnaJ homologue that functions as a co‑chaperone of DnaK/hypothetical protein

GATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGC  >  W3110S.gb/1064389‑1064452 |                                                                gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:505775/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1786099/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1814287/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1819992/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1880046/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:193863/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:25246/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:278410/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:367700/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:483984/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:504549/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1779091/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:524736/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:553026/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:586589/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:640077/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:673906/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:679044/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:731733/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:788715/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:822916/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:949671/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1476239/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1032080/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1034172/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1054476/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1055815/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1126058/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1130509/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1223335/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:130623/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1419521/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1429728/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1011511/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1523332/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1557793/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1583449/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1609461/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1663048/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1671295/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1706868/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1722183/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1732964/64‑1 (MQ=255) gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGATTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc  <  1:1501390/64‑1 (MQ=255) |                                                                GATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGC  >  W3110S.gb/1064389‑1064452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑