Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1071256	1071539	284	67 [0]	[0] 29	[ycdI]–[rarA]	[ycdI],[rarA]

ACATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGA  >  W3110S.gb/1071540‑1071603 |                                                                aCATTCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1645898/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:332438/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:965991/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:912362/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:887730/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:848753/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:801034/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:792788/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:75715/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:745758/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:567788/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:521049/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:47712/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:466350/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:439637/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:359917/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:101608/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:31715/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:271723/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:257262/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1696998/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1585951/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1442655/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:137364/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1365362/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1333153/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:123576/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1117192/64‑1 (MQ=255) aCATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGa  <  1:1029879/64‑1 (MQ=255) |                                                                ACATGCTGTTGGCACCAGCAGATCATCACTGGCGCAGATGATTTGCACCGGGCAGCGGATGCGA  >  W3110S.gb/1071540‑1071603

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑