Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1086609	1086924	316	152 [0]	[0] 41	ycdP	predicted inner membrane protein

ATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAT  >  W3110S.gb/1086925‑1086965 |                                         ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:666049/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:277568/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:365036/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:37190/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:434167/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:445283/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:445621/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:463883/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:540091/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:574894/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:651967/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:268586/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:69640/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:697563/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:825781/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:826910/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:852589/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:88943/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:899060/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:931953/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:976603/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1603908/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:109817/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1167191/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1213292/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1246857/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1248963/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1404601/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1477945/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:150049/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1563660/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:106297/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1608747/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1670350/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1671796/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1673711/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1742120/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1754588/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1802796/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1818155/41‑1 (MQ=255) ataatTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt  <  1:1855553/41‑1 (MQ=255) |                                         ATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAT  >  W3110S.gb/1086925‑1086965

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑