Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1104928	1105198	271	3 [0]	[0] 56	[csgA]	[csgA]

AATATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCA  >  W3110S.gb/1105199‑1105263 |                                                                 aaTATGAATTCGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCATATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1541717/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCTCTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:840044/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACccacca  <  1:2510/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCATCa  <  1:3836/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:610020/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1868019/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1869734/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:305082/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:405739/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:415222/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:434764/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:523007/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:542022/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:544715/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:567142/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:589488/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1855517/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:613868/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:697867/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:71898/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:730746/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:746976/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:750226/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:809860/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:812335/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:839418/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:90828/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:924243/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:982091/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:144021/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1041343/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1098058/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1137799/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1146812/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1153852/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1163841/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1177903/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1226603/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1237440/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1289582/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1289716/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1320966/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1377203/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1040617/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:150247/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1511098/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1520090/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:159330/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1598056/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1668975/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1705041/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1724176/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:173554/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1746006/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1794714/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCa  <  1:1830921/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATATGAATACGTTATTACTCCTTGCGGCACTTTCCAGTCAGATAACCTTTAATACGACCCAGCA  >  W3110S.gb/1105199‑1105263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑