Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1107494	1107598	105	8 [0]	[0] 31	ymdB	conserved hypothetical protein

CGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCGTGGTG  >  W3110S.gb/1107599‑1107661 |                                                               cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGGCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:35417/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTc            >  1:635722/1‑53 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1044389/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:992457/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:975430/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:938827/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:864579/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:68869/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:655192/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:619584/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:614225/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:403982/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:308367/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:220049/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:219011/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:184902/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1823171/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1796957/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1722725/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1486566/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1432184/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1307853/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1207765/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1206611/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1174867/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1150428/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1149905/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:114109/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCgtggtg  >  1:1035273/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGAgtggtg  >  1:1470982/1‑63 (MQ=255) cGCTTGCAGGCGATCTTACCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCgg                   >  1:1825499/1‑46 (MQ=255) |                                                               CGCTTGCAGGCGATCTTCCCGCTAAAGCCGTAGTGCACACCGTCGGGCCAGTCTGGCGTGGTG  >  W3110S.gb/1107599‑1107661

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑