Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1132863	1132889	27	63 [0]	[0] 21	flgB	flagellar component of cell‑proximal portion of basal‑body rod

CCGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGC  >  W3110S.gb/1132890‑1132933 |                                            ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:286134/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:890222/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:794284/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:736879/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:62729/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:576098/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:567385/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:362316/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:336489/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:330410/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:326077/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1102781/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1781435/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1692870/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1591112/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:15581/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1483122/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1399272/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1296697/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:1197576/44‑1 (MQ=255) ccGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGc  <  1:118959/44‑1 (MQ=255) |                                            CCGTCGATATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGC  >  W3110S.gb/1132890‑1132933

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑