Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1163574	1163675	102	24 [0]	[0] 47	hinT	purine nucleoside phosphoramidase

TTGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGC  >  W3110S.gb/1163676‑1163740 |                                                                 ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATAGCAACCGCCATGGc  <  1:1366069/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:572545/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1691189/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1706554/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1747550/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1799514/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1799991/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1818997/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:196363/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:243717/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:380681/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:416095/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:485453/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1648930/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:630646/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:654875/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:676744/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:678826/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:797409/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:811617/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:83876/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:915503/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:942970/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:972963/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1470019/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1056392/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1122475/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1125428/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1235199/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1311606/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1316598/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:135808/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1364639/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1390611/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1430128/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1449585/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1679685/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1476211/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:148535/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:150161/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1531169/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1540228/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1581002/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1583657/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1617774/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1640807/65‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGc  <  1:1009487/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTGCTGAGCAAGAAGGTATTGCCGAAGATGGCTATCGTCTGATCATGAATACCAACCGCCATGGC  >  W3110S.gb/1163676‑1163740

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑